Kasat-ribut supervillain Megamind akhirnya mengalahkan musuh bebuyutannya, superhero Metro Man. Tetapi tanpa seorang pahlawan, ia kehilangan semua tujuan dan harus menemukan makna baru bagi hidupnya.
Seorang tokoh mini Lego biasa, yang keliru dianggap sebagai MasterBuilder yang luar biasa, direkrut untuk bergabung dengan sebuah pencarian untuk menghentikan seorang tiran Lego jahat dari menempelkan alam semesta bersama.